История научной деятельности Национального института фтизиатрии и пульмонологии им. Ф.Г. Яновского берет свое начало в 1922 году, когда он был основан постановлением правительства Украины. Сегодня институт – головное научно-исследовательское учреждение в Украине по проблемам фтизиатрии и пульмонологии. В его структуре 13 научных и 3 научно-вспомогательных подразделений, в которых работают свыше 100 научных сотрудников, в том числе 3 лауреата Государственной премии Украины, 1 академик и 1 член-корреспондент АМН Украины, 13 профессоров, 22 доктора, более 60 кандидатов науки. Собственная клиническая база института – это 410 специализированных коек фтизиатрического, пульмонологического и торакального профиля. Научные подразделения оснащены современной научно-исследовательской аппаратурой, в частности, для проведения диагностики заболеваний органов дыхания – рентгенологическими, функциональными, ультразвуковыми, эндоскопическими, микробиологическими, биохимическими, иммунологическими, цитологическими и патоморфологическими методами на мировом уровне. Институт имеет собственную экспериментальную базу для проведения исследований на мелких лабораторных животных.

   В настоящее время основными направлениями научной деятельности института  являются:

• разработка новых и усовершенствование существующих способов и методов диагностики, лечения, диспансеризации и профилактики туберкулеза у взрослого населения, детей и подростков. Особое внимание уделяется вопросам разработки интенсивных режимов химиотерапии, лечению больных туберкулезом органов дыхания, вызванного мультирезистентными штаммами микобактерий и больных с рецидивами туберкулеза;
• разработка новых и усовершенствование существующих способов и методов диагностики, лечения, диспансеризации и профилактики неспецифических заболеваний органов дыхания. Первостепенное внимание уделяется изучению механизмов бронхообструкции, проблемам диагностики и лечения бронхиальной астмы, хронического обструктивного бронхита, пневмонии, сонного апное, вопросам фармакоекономики;
• разработка хирургических методов лечения туберкулеза и неспецифических заболеваний органов дыхания, коррекции тяжелых послеоперационных осложнений, в том числе с использованием современных лазерных, ультразвуковых и криотехнологий;
• изучение механизмов нарушений иммунологической системы при различных заболеваниях органов дыхания, разработка новых иммунологических методов диагностики туберкулеза и других заболеваний легких, методов иммунокоррекции при различных патологических состояниях;
• изучение механизмов нарушений клеточного энергетического обмена при туберкулезе;
• разработка фотогистохимических экспресс-методов диагностики туберкулеза и онкологических заболеваний органов дыхания, изучение механизмов онкотрансформации клеток;
• усовершенствование методов микробиологической диагностики туберкулеза, выявления и идентификации L-форм микобактерий туберкулеза;
• внедрение современных методов микробиологической диагностики туберкулеза и оказание организационно-методической помощи профильным лабораториям противотуберкулезных учреждений Украины, для чего в институте создана референс-лаборатория микробиологической диагностики туберкулеза;
• разработка новых методов лекарственной терапии хронической легочно-сердечной недостаточности и легочной гипертензии, синдрома гиперкоагуляции;
  
• клиническое изучение в соответствии с международным стандартом новых лекарственных средств (III - IV фазы) и новой медицинской техники. Институтом разработаны оригинальные лекарственные препараты Теком и Теком-А, совместно с Институтом фармакологии и токсикологии АМН Украины разработан лекарственный препарат Липин, которые выпускаются или планируются в выпуску отечественной фармакологической промышленностью;
• разработка научно-обоснованных предложений по усовершенствованию организации противотуберкулезной и пульмонологической помощи населению Украины, подготовка проектов законодательных и нормативных актов по этим проблемам;
• организация и проведение съездов фтизиатров, пульмонологов и аллергологов Украины, республиканских школ пульмонологов, ежегодных совещаний главных фтизиатров и главных пульмонологов административных территорий Украины;
• издательская деятельность. Институт совместно с Ассоциацией фтизиатров и пульмонологов Украины издает "Украинский пульмонологический журнал", совместно с Ассоциацией химиотерапевтов Украины - "Украинский химиотерапевтический журнал" и совместно с Ассоциацией специалистов по проблемам бронхиальной астмы и аллергии Украины - журнал "Астма и аллергия", ежегодные статистические сборники с анализом эпидемиологической ситуации по туберкулезу и неспецифическим заболеваниям органов дыхания в Украине;
• внедрение результатов научных исследований в практику лечебно-профилактических учреждений Украины, подготовка и издание методических рекомендаций, информационных писем, ведомственных инструкций, нововведений;
• подготовка научных кадров, повышение квалификации врачей-фтизиатров, пульмонологов, аллергологов, торакальных хирургов.